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内容简介
苑世领、张恒、张冬菊编著的《分子模拟--理论与实验》，第一篇主要介绍分子模拟技术基础理论，内容涉及量子力学方法和分子力学方法，其中重点介绍了基于分子力学的分子动力学模拟的基本理论和实际应用。第二篇为9个有代表性的实验，内容涉及无机、有机、胶化、高分子等学科，可供读者亲自上机操作，重在帮助学生从分子层次上理解化学物质的结构性能关系、动力学性质和反应特性等，培养学生采用分子模拟技术解决化学问题的能力，并激发学生的科研兴趣。 《分子模拟--理论与实验》可供从事计算化学的科研工作者使用，也可作为化学化工专业本科生、研究生的教材。
作者介绍
苑世领，山东大学化学化工学院，副院长，教授、博导，自1999年开始，为化学院本科生讲授《物理化学》，并从2005年为研究生开设《分子模拟及其应用》课程。 自2000年以来从事分子模拟计算工作，先后承担五个国家自然科学基金项目及多个油田横向项目，发表SCI论文一百余篇。
目 录
第一篇 分子模拟理论基础 第1章 绪论 1.1 分子模拟 1.2 基本概念 1.2.1 坐标系 1.2.2 分子图形 1.2.3 分子表面 1.2.4 原子模型和粗粒模型 1.2.5 模拟方法 1.3 分子模拟历史 1.3.1 早期的刚性球势和Lennard-Jones势 1.3.2 小的非极性分子 1.3.3 极性分子和离子 1.3.4 链分子和聚合物 1.3.5 分子模拟中的系综 1.3.6 多体相互作用 1.3.7 非平衡分子动力学模拟 1.4 模拟资源 参考文献 第2章 统计力学基础 2.1 统计力学基本原理 2.1.1 系综 2.1.2 热力学平均 2.1.3 其他涨落热力学性质 2.1.4 输运系数 2.2 粒子动力学 2.2.1 非约束粒子的运动 2.2.2 受约束粒子的运动 2.2.3 维里定理 参考文献 第3章 力场 3.1 势函数 3.2 简正模式 3.2.1 特征运动 3.2.2 分子光谱 3.2.3 光谱与力常数 3.3 简单体系的分子力场 3.4 势能函数的具体形式 3.4.1 键伸缩势 3.4.2 键角弯曲势 3.4.3 二面角扭转势 3.4.4 离平面的弯曲势 3.4.5 交叉项 3.4.6 van der Waals势 3.4.7 静电相互作用 3.4.8 氢键势 3.5 常见的力场 3.5.1 OPLS力场 3.5.2 ECEPP/3力场 3.5.3 AMBER力场 3.5.4 CHARMM力场 3.5.5 MM3力场 3.5.6 CFF力场 3.5.7 通用力场 3.5.8 COMPASS力场 3.6 联合原子和约化处理 3.7 粗粒力场 3.7.1 MARTINI力场 3.7.2 从全原子到粗粒模型 3.8 多体势 3.9 水分子力场 3.9.1 简单水分子模型 3.9.2 可极化水分子模型 3.10 选择力场 3.10.1 力场的命名 3.10.2 力场的发展趋势 3.10.3 如何选择力场 …… 第6章 Monte Carlo 模拟 第7章 分子动力学模拟 第8章 介观模拟 第9章 量子化学 第二篇 分子模拟实验 第10章 分子模型的创建与优化 第11章 分子轨道的计算和分析 第12章 势能面计算 第13章 化学反应模拟 第14章 分子光谱计算 第15章 溶液行为的分子动力学模拟 第16章 固体材料表面吸附行为的Monte Carlo模拟 第17章 表面活性剂聚集行为的介观模拟 第18章 生物膜的粗粒化模拟 参考文献 附录 后记
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